I dag vil folk som ønsker å sende varer (eller flytte folk) trolig innse at det ikke alltid gir mening å holde seg til bare en transportform. For eksempel kan lasten lastes fra et skip til en lastebil, som overfører den til en railyard, hvorfra den blir flyttet over hele landet med tog. Intermodal transport kan være mer effektiv og billigere; i noen tilfeller har det imidlertid uttalt ulemper med hensyn til fart og pålitelighet.
Hastighet
Selv om intermodal transport gir fordelen av relativt lave kostnader i forhold til andre metoder, oppnår den dette ved å ofre hastighet; når som helst last blir overført til en forholdsvis langsommere transportmiddel, for eksempel tog, som opererer på faste skinner som ikke kan tilby som direkte rute som veiene en lastebil bruker, senker den. For å operere med høy effektivitet, må intermodal transport også redusere mengden tid som ventes i depoter for at en ny operatør skal ankomme eller at lasten skal lastes ut.
Mangel på pålitelighet
På grunn av sin tillit til mer enn en transittmodus, er intermodal transport også gjenstand for lavere total pålitelighet; Etter hvert som kjeden av forskjellige moduser vokser, øker muligheten for noen kobling i kjedebruddene også. Dette er spesielt problematisk når en av transportmodusene er jernbane; jernbaner er mer utsatt for forsinkelser introdusert ved dårlig vær eller utstyrssvikt. Av denne grunn, så vel som bekymringer over fart, er avsendere som krever pålitelig høyhastighets transport mindre sannsynlighet for å vurdere intermodale systemer.
Skader
Når lasten skal blandes rundt, risikere skippere muligheten for skade som frakt overføres fra en transportmetode til en annen. Heldigvis kan denne faren reduseres, men det medfører vanligvis overpacking ved å legge til mer bracing og beskyttende materiale enn det som normalt anses å være tilstrekkelig. Denne ekstra vekten og bekostningen motvirker delvis fordelene som intermodal transport har når det gjelder energieffektivitet og kostnad.
Høye infrastrukturkostnader
Intermodal godstransport lider også av relativt høye infrastrukturkostnader. Containerisering har senket kostnadene og vanskeligheten ved å transportere varer ved å standardisere deres form; Avsendere kan enkelt flytte den samme beholderen fra et skip til et tog til en lastebil. Håndtering av disse beholderne krever imidlertid at avsendere har de tunge kranene og utstyret som er nødvendig for å manipulere store beholdere; Denne infrastrukturen kan ikke eksistere på alle steder, spesielt i utviklingsland.
